Denna säsong mobiliserar agenterna ”G” Callen (Chris O’Donnell) och Sam Hanna (LL Cool J), specialagent Kensi Blye (Daniela Ruah), LAPD-kontakten Marty Deeks (Eric Christian Olsen), tekniksnillet Eric Beale (Barrett Foa) och analytikern Nell Jones (Renée Felice Smith) för att skydda verksamhetschefen Hetty Lange (Oscar®-belönade Linda Hunt*) mot en livsfarlig fiende – samtidigt som de utreds av Justitiedepartementet. Assisterande NCIS-chef Owen Granger (Miguel Ferrer) försöker hålla enheten i styr, en enhet som inte skyr några medel för att försvara sitt land.