Mänsklighetens framtid vilar på en knivsegg. Jorden har övergivits och är nu hemvist åt märkliga och mäktiga varelser. Det enda som återstår av mänskligheten har flytt till en koloni i yttre rymden. Efter att ha färdats från kolonin beger sig EVE ut på ett uppdrag på den ärrade planeten: att rädda mänskligheten och återta jorden från Nova sapiens – de ondskefulla varelser som ödelagt världen. Men i takt med att EVE stångas med Nova sapiens en efter en bland den mänskliga civilisationens ruiner och rester och börjar pussla ihop sanningen om det som hänt inser hon att hennes uppdrag är allt annat än enkelt. Faktum är att inget är vad det verkar v ara.