Desperados III är ett taktiskt realtidsspel som utspelar sig i det hänsynslösa Vilda Västern. Spelaren tar kontroll över en löst sammansatt grupp som gradvis växer till en välövad hjältestyrka. De mycket olika personligheterna är svåra att samarbeta med i början, men snart kommer huvudpersonerna samman för att utveckla sina unika förmågor med en skenbar överlägsen motståndare. Desperados, som jagas av hänsynslösa banditer och korrupta poliser, måste vända på steken i varje uppdrag.